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養殖業の開業ガイド

必要な許認可・費用・手続きの流れを徹底解説

最終更新: 2026-04-16

14

必須の許認可

10,000〜80,000円

費用の目安(合計)

最大180日

想定期間

むずかしい

最大難易度

養殖業とは

養殖業の開業には、農地法や漁業法に基づく許認可が必要です。地域の農業委員会や漁業協同組合との調整が重要なステップとなります。

魚介類の養殖

養殖業を開業するには、合計15件の許認可が関係します(必須: 14件、条件付き: 1件)。 このガイドでは、それぞれの許認可について費用・期間・必要書類を詳しく解説し、 開業までの具体的なステップをご案内します。

開業までのリアルなタイムライン

全ての許認可取得に6ヶ月程度。並行して進められる手続きもあるため、効率的なスケジュールを組みましょう。

農林水産省管轄

水産試験場利用許可7〜14日
7〜14日
水産用医薬品使用届出7〜14日
7〜14日
内水面漁業協同組合設立認可60〜120日
60〜120日
特定区画漁業権免許60〜180日
60〜180日
養殖業許可30〜60日
30〜60日
内水面漁業許可30〜60日
30〜60日
漁業協同組合設立認可60〜120日
60〜120日
海面養殖業許可30〜90日
30〜90日
水産資源管理計画認定30〜60日
30〜60日
水産資源保護法許可14〜30日
14〜30日
漁業許可30〜90日
30〜90日
漁業権免許60〜180日
60〜180日
養殖業登録30〜60日
30〜60日

税務署管轄

個人事業の開業届約1日
約1日

※ 異なる管轄の許認可は並行して申請できる場合があります。同じ管轄の許認可は順番に申請が必要な場合があります。

養殖業の開業までのステップ

1

事業計画の策定

養殖業の事業計画を策定します。事業内容・ターゲット・収支計画を明確にし、必要な許認可を洗い出しましょう。

2

資金調達・物件確保

開業資金を調達し、営業拠点となる物件を確保します。許認可によっては施設基準があるため、物件選定時に要件を確認しましょう。

3

許認可の申請・取得

必要な許認可を一つずつ申請していきます。申請順序にも注意が必要です。先に取得が必要な許認可がある場合があります。

4

届出・登録手続き

税務署への開業届、社会保険の届出、各種届出を行います。法人設立の場合は登記も必要です。

5

開業・営業開始

全ての許認可を取得し、届出が完了したら営業を開始できます。許認可の更新時期を管理し、期限切れに注意しましょう。

養殖業に必要な許認可一覧

必須の許認可(14件)

必須かんたん

都道府県の水産試験場の施設や海面を利用するための許可。研究・試験目的。

管轄農林水産省
費用0〜5,000円
期間7〜14日
更新1年ごと
申請ステップを見る(4ステップ)
  1. 利用許可申請書の作成
  2. 利用目的の明示
  3. 水産試験場への申請
  4. 許可証の交付
必要書類(3件)
  • 利用許可申請書- 水産試験場の利用許可を申請する書類
  • 利用計画書- 施設の利用目的と計画
  • 研究概要書- 研究・試験の概要を記載した書類
必須かんたん

個人事業主として事業を開始した場合に提出する届出。開業から1ヶ月以内に提出する必要があります。

管轄税務署
費用無料
期間約1日
更新更新不要

個人事業の場合

申請ステップを見る(4ステップ)
  1. 開業届出書(様式)を国税庁サイトからダウンロード
  2. 必要事項を記入
  3. 管轄の税務署に提出(郵送可)
  4. 受付印を押された控えを受け取る
必要書類(2件)
  • 本人確認書類- マイナンバーカード又は通知カード+運転免許証等
  • 個人事業の開業・廃業等届出書- 国税庁サイトからダウンロード可能

養殖業において水産用医薬品を使用する場合の届出。薬事法に基づく適正使用。

管轄農林水産省
費用無料
期間7〜14日
更新更新不要
申請ステップを見る(3ステップ)
  1. 使用計画の策定
  2. 使用記録の整備
  3. 都道府県知事への届出
必要書類(3件)
  • 使用届出書- 水産用医薬品の使用に関する届出書
  • 使用計画書- 医薬品の使用計画を記載した書類
  • 使用記録簿- 医薬品の使用記録を管理する帳簿

河川・湖沼における漁業協同組合を設立するための認可。都道府県知事の認可が必要。

管轄農林水産省
費用無料
期間60〜120日
更新更新不要
申請ステップを見る(6ステップ)
  1. 設立発起人の選定
  2. 定款の作成
  3. 組合員の募集
  4. 設立総会の開催
  5. 都道府県知事への認可申請
  6. 認可・登記
必要書類(4件)
  • 設立認可申請書- 内水面漁業協同組合の設立認可申請書
  • 定款- 組合の定款
  • 事業計画書- 組合の事業計画
  • 組合員名簿- 組合員の名簿
必須むずかしい

特定の海面区画において養殖等を行うための漁業権免許。都道府県知事が免許する。

管轄農林水産省
費用0〜10,000円
期間60〜180日
更新5年ごと
申請ステップを見る(5ステップ)
  1. 免許申請書の作成
  2. 漁業計画の策定
  3. 海区漁業調整委員会の意見聴取
  4. 都道府県知事への申請
  5. 免許証の交付
必要書類(3件)
  • 漁業権免許申請書- 特定区画漁業権の免許申請書
  • 漁業計画書- 養殖等の漁業計画を記載した書類
  • 区画図- 使用する海面区画を示す図面
必須ふつう

水産動植物の養殖を行うための許可

管轄農林水産省
費用5,000〜20,000円
期間30〜60日
更新5年ごと
申請ステップを見る(3ステップ)
  1. 管轄の都道府県に申請
  2. 区画漁業権の設定確認
  3. 許可証の交付
必要書類(4件)
  • 漁船の登録票の写し- 漁船の登録を証明する書面の写し
  • 漁業許可申請書- 所定の様式による漁業許可申請書
  • 漁場の見取図- 漁場の位置を示す見取図
  • 操業計画書- 漁業の操業計画を記載した書面
必須ふつう

河川や湖沼等の内水面において漁業を営むための許可。都道府県知事の許可が必要。

管轄農林水産省
費用0〜5,000円
期間30〜60日
更新5年ごと
申請ステップを見る(5ステップ)
  1. 許可申請書の作成
  2. 漁業計画の策定
  3. 内水面漁場管理委員会の意見聴取
  4. 都道府県知事への申請
  5. 許可証の交付
必要書類(3件)
  • 内水面漁業許可申請書- 内水面での漁業許可を申請する書類
  • 漁業計画書- 漁業の内容と計画を記載した書類
  • 漁場図- 操業する水面の位置を示す図面
必須むずかしい

漁業者が協同して経済活動を行うための漁業協同組合を設立する際の認可。

管轄農林水産省
費用無料
期間60〜120日
更新更新不要
申請ステップを見る(6ステップ)
  1. 設立発起人の選定
  2. 定款の作成
  3. 組合員の募集
  4. 設立総会の開催
  5. 都道府県知事への認可申請
  6. 認可・登記
必要書類(4件)
  • 設立認可申請書- 漁業協同組合の設立認可を申請する書類
  • 定款- 組合の定款
  • 事業計画書- 組合の事業計画を記載した書類
  • 設立総会議事録- 設立総会の議事録
必須むずかしい

海面において魚介類・海藻類の養殖を行うための許可。養殖施設の設置を含む。

管轄農林水産省
費用0〜10,000円
期間30〜90日
更新5年ごと
申請ステップを見る(5ステップ)
  1. 許可申請書の作成
  2. 養殖計画の策定
  3. 施設配置図の作成
  4. 都道府県知事への申請
  5. 審査・許可
必要書類(3件)
  • 海面養殖業許可申請書- 海面での養殖業許可を申請する書類
  • 養殖計画書- 養殖の内容と計画を記載した書類
  • 施設配置図- 養殖施設の海面上の配置を示す図面

水産資源の持続的利用のための資源管理計画を策定・認定してもらう制度。

管轄農林水産省
費用無料
期間30〜60日
更新5年ごと
申請ステップを見る(4ステップ)
  1. 資源管理計画の策定
  2. 関係漁業者との協議
  3. 都道府県知事への認定申請
  4. 審査・認定
必要書類(3件)
  • 資源管理計画書- 水産資源の管理に関する計画書
  • 関係者同意書- 関係漁業者の同意を示す書類
  • 資源量調査データ- 対象水産資源の調査データ

水産資源の保護培養のために定められた保護水面における漁業活動の許可。

管轄農林水産省
費用無料
期間14〜30日
更新更新不要
申請ステップを見る(4ステップ)
  1. 許可申請書の作成
  2. 漁業計画の策定
  3. 都道府県知事への申請
  4. 審査・許可
必要書類(3件)
  • 許可申請書- 水産資源保護法に基づく許可申請書
  • 漁業計画書- 保護水面での漁業計画
  • 資源保護計画書- 水産資源の保護に関する計画
必須ふつう

特定の漁業を営むための許可

管轄農林水産省
費用5,000〜30,000円
期間30〜90日
更新5年ごと
申請ステップを見る(3ステップ)
  1. 管轄の都道府県に申請
  2. 漁業調整委員会の審査
  3. 許可証の交付
必要書類(4件)
  • 漁場の見取図- 漁場の位置を示す見取図
  • 漁業許可申請書- 所定の様式による漁業許可申請書
  • 漁業従事者名簿- 漁業に従事する者の名簿
  • 漁船の登録票の写し- 漁船の登録を証明する書面の写し
必須むずかしい

一定の水面において特定の漁業を営む権利を得るための免許。定置漁業権、区画漁業権、共同漁業権の3種類がある。

管轄農林水産省
費用無料
期間60〜180日
更新10年ごと
申請ステップを見る(5ステップ)
  1. 免許申請書の作成
  2. 漁業計画の策定
  3. 都道府県知事への申請
  4. 海区漁業調整委員会の意見聴取
  5. 免許の付与
必要書類(4件)
  • 漁業権免許申請書- 漁業権の免許を申請するための書類
  • 漁業計画書- 漁業経営の計画を記載した書類
  • 漁場図- 漁業を行う水面の位置と範囲を示す図面
  • 経営収支計画書- 漁業経営の収支見込みを記載した書類
必須ふつう

水産動植物の養殖業を営むための登録。内水面・海面での養殖に必要となる。

管轄農林水産省
費用無料
期間30〜60日
更新5年ごと
申請ステップを見る(5ステップ)
  1. 登録申請書の作成
  2. 養殖計画の策定
  3. 施設図面の準備
  4. 都道府県知事への申請
  5. 審査・登録
必要書類(4件)
  • 養殖業登録申請書- 養殖業の登録を申請する書類
  • 養殖計画書- 養殖する魚種と計画を記載した書類
  • 施設配置図- 養殖施設の配置を示す図面
  • 水質管理計画書- 養殖場の水質管理に関する計画書

条件によって必要になる許認可(1件)

条件付きふつう

株式会社や合同会社を設立するための登記。定款認証・資本金払込みの後に申請します。

管轄法務局
費用60,000〜242,000円
期間7〜14日
更新更新不要

法人設立の場合

申請ステップを見る(5ステップ)
  1. 定款の作成
  2. 定款の認証(株式会社の場合、公証役場で)
  3. 資本金の払込み
  4. 設立登記申請書を法務局に提出
  5. 登記完了(約1〜2週間)
必要書類(4件)
  • 法人設立登記申請書- 法人設立登記に必要な所定の様式による申請書
  • 身分証明書- 本籍地の市区町村長が発行する身分証明書
  • 納税証明書- 税務署発行の納税証明書
  • 定款の写し(法人の場合)- 法人の定款の写し

養殖業の開業にかかる許認可費用の目安

10,000〜80,000円

必須許認可の取得費用合計(申請手数料のみ)

※ 上記は申請手数料のみの目安です。行政書士に依頼する場合は別途報酬(3〜15万円程度/件)がかかります。 設備投資費・物件取得費は含みません。

開業までの想定期間

最大 約180日

最も時間のかかる許認可の取得期間

複数の許認可を並行して申請できる場合もあります。 ただし、先に取得が必要な許認可がある場合は順番に申請する必要があるため、 余裕を持ったスケジュールを立てましょう。

特定区画漁業権免許60〜180日
漁業権免許60〜180日
内水面漁業協同組合設立認可60〜120日
漁業協同組合設立認可60〜120日
海面養殖業許可30〜90日
漁業許可30〜90日
養殖業許可30〜60日
内水面漁業許可30〜60日
水産資源管理計画認定30〜60日
養殖業登録30〜60日
水産資源保護法許可14〜30日
水産試験場利用許可7〜14日
水産用医薬品使用届出7〜14日
個人事業の開業届約1日

養殖業の開業資金の全体像

許認可費用だけでなく、設備投資や運転資金も含めた開業資金の全体像を把握しましょう。

許認可の申請手数料
10,000〜80,000円

必須の14件の許認可取得にかかる申請手数料の合計

行政書士への報酬(目安)
112万〜210万円

専門家に申請代行を依頼する場合の報酬。自分で申請する場合は不要

設備投資(参考)
500万〜3,000万円(農機具・施設・土地)

事業に必要な設備・内装等の初期投資の参考額

運転資金(目安)
月商の6ヶ月分以上(300万〜1,000万円)

開業後、売上が安定するまでの運転資金

※ 設備投資額・運転資金は事業規模や地域によって大きく異なります。 上記はあくまで参考値です。実際の開業計画に合わせて、詳細な資金計画を策定してください。 日本政策金融公庫の「創業計画書」の作成をおすすめします。

先輩事業者の声 - 開業前に知っておきたいこと

1ポイント 1

農地の取得・転用には農業委員会の許可が必要です。手続きに数ヶ月かかるため、早めに相談しましょう。

2ポイント 2

新規就農者向けの支援制度(補助金・融資)が充実しています。自治体の農業担当部署に相談しましょう。

3ポイント 3

6次産業化(加工・販売まで手がける場合)は、追加の許認可が必要です。事業計画段階で検討しておきましょう。

養殖業で気をつけるべき法規制

養殖業に関連する主な法律と、違反した場合の罰則をまとめました。 法令を遵守し、適正な事業運営を行いましょう。

1

農地法

農地の権利移動や転用を規制する法律。無許可転用には罰則(3年以下の懲役または300万円以下の罰金)があります。

2

漁業法

漁業権の設定と漁業の秩序維持を規定。無許可操業には罰則があります。

3

食品衛生法

農水産物の加工・販売を行う場合に営業許可が必要です。

この業種の許認可に関連する法令:

各都道府県条例所得税法第229条医薬品、医療機器等の品質、有効性及び安全性の確保に関する法律水産業協同組合法漁業法第62条漁業法第67条漁業法第119条水産業協同組合法第25条漁業法第65条水産資源保護法水産資源保護法第4条漁業法第57条会社法第49条

養殖業の開業に必要な書類まとめ

全ての許認可で必要となる書類を重複なくまとめました。 事前に準備しておくことで、スムーズに申請を進められます。

必須書類(33件)
  • 利用許可申請書

    水産試験場の利用許可を申請する書類

  • 利用計画書

    施設の利用目的と計画

  • 本人確認書類

    マイナンバーカード又は通知カード+運転免許証等

  • 個人事業の開業・廃業等届出書

    国税庁サイトからダウンロード可能

  • 使用届出書

    水産用医薬品の使用に関する届出書

  • 使用計画書

    医薬品の使用計画を記載した書類

  • 使用記録簿

    医薬品の使用記録を管理する帳簿

  • 設立認可申請書

    内水面漁業協同組合の設立認可申請書

  • 定款

    組合の定款

  • 事業計画書

    組合の事業計画

  • 組合員名簿

    組合員の名簿

  • 漁業権免許申請書

    特定区画漁業権の免許申請書

  • 漁業計画書

    養殖等の漁業計画を記載した書類

  • 区画図

    使用する海面区画を示す図面

  • 漁船の登録票の写し

    漁船の登録を証明する書面の写し

  • 漁業許可申請書

    所定の様式による漁業許可申請書

  • 漁場の見取図

    漁場の位置を示す見取図

  • 操業計画書

    漁業の操業計画を記載した書面

  • 内水面漁業許可申請書

    内水面での漁業許可を申請する書類

  • 漁場図

    操業する水面の位置を示す図面

  • 設立総会議事録

    設立総会の議事録

  • 海面養殖業許可申請書

    海面での養殖業許可を申請する書類

  • 養殖計画書

    養殖の内容と計画を記載した書類

  • 施設配置図

    養殖施設の海面上の配置を示す図面

  • 資源管理計画書

    水産資源の管理に関する計画書

  • 関係者同意書

    関係漁業者の同意を示す書類

  • 許可申請書

    水産資源保護法に基づく許可申請書

  • 資源保護計画書

    水産資源の保護に関する計画

  • 漁業従事者名簿

    漁業に従事する者の名簿

  • 経営収支計画書

    漁業経営の収支見込みを記載した書類

  • 養殖業登録申請書

    養殖業の登録を申請する書類

  • 法人設立登記申請書

    法人設立登記に必要な所定の様式による申請書

  • 身分証明書

    本籍地の市区町村長が発行する身分証明書

状況によって必要な書類(5件)
  • 研究概要書

    研究・試験の概要を記載した書類

  • 資源量調査データ

    対象水産資源の調査データ

  • 水質管理計画書

    養殖場の水質管理に関する計画書

  • 納税証明書

    税務署発行の納税証明書

  • 定款の写し(法人の場合)

    法人の定款の写し

養殖業の開業に関するよくある質問

Q. 水産試験場の利用は一般の漁業者でもできますか?

A. 都道府県の水産試験場は主に研究機関向けですが、漁業者の技術研修や共同研究の形で利用できる場合があります。

Q. 利用申請の審査基準は?

A. 利用目的の公益性、研究・試験の妥当性、施設の空き状況等が審査されます。

Q. 水産試験場利用許可の申請で注意すべきポイントや要件は何ですか?

A. 届出書類の記載内容に不備がないよう、事前に農林水産省や管轄窓口に確認することをお勧めします。届出後も法令改正に注意し、変更があれば速やかに届出内容を更新してください。関連する他の届出・許可が必要な場合もあるため、事前に全体像を把握しておくことが重要です。

Q. 開業届を出さないとどうなりますか?

A. 罰則はありませんが、青色申告ができない、屋号での銀行口座開設ができない等のデメリットがあります。事業を始めたら速やかに届出しましょう。

Q. 個人事業の開業届の取得にかかる費用と期間はどれくらいですか?

A. 届出手数料は無料〜数千円程度で、手続きは比較的簡単です。必要書類を揃えて提出すれば、通常1〜4週間程度で受理されます。行政書士等に依頼する場合は別途3〜5万円程度の報酬がかかります。

Q. 個人事業の開業届の申請で注意すべきポイントや要件は何ですか?

A. 届出書類の記載内容に不備がないよう、事前に税務署や管轄窓口に確認することをお勧めします。届出後も法令改正に注意し、変更があれば速やかに届出内容を更新してください。関連する他の届出・許可が必要な場合もあるため、事前に全体像を把握しておくことが重要です。

Q. 水産用医薬品はどこで購入できますか?

A. 動物用医薬品販売業の許可を受けた販売店や漁業協同組合を通じて購入できます。

Q. 使用記録はどのくらいの期間保管する必要がありますか?

A. 使用記録は3年間の保管が推奨されています。トレーサビリティの観点から適切な記録管理が重要です。

Q. 水産用医薬品使用届出の申請で注意すべきポイントや要件は何ですか?

A. 届出書類の記載内容に不備がないよう、事前に農林水産省や管轄窓口に確認することをお勧めします。届出後も法令改正に注意し、変更があれば速やかに届出内容を更新してください。関連する他の届出・許可が必要な場合もあるため、事前に全体像を把握しておくことが重要です。

Q. 内水面漁業協同組合の役割は?

A. 河川・湖沼の漁場管理、稚魚の放流、遊漁券の発行・管理、漁業権の管理等を行います。

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